选择合适的操作系统。在网络开发中安装数据库服务端的时候，Linux操作系统应该作为优先选择，因为相比windows系统，Linux操作系统具有较高的安全性。当然，如果有条件的话，一些企业或者个人可以选择安全性更高的UNIX操作系统等。从网络数据库运行的角度来讲，病毒的侵犯是最主要的威胁，因此，治理外围层的方法应该是防、管、杀三者相结合，并且通过应用VPN技术来建立一个虚拟的网络开发之中数据库系统的专用网，与此同时，通过对防火墙技术的应用来实现网间以及网段间的双重隔离，从而避免因病毒等的入侵而造成的安全威胁。此外，对数据也需要进行加密保护以免数据在传输过程中被窃取或者篡改。
加强对软件设施的投资。注重网站开发之中数据库的安全管理是非常有必要的，因为无论硬件设施有多么的先进，如果没有相应的管理，那么硬件设施也无法发挥出其应有的价值。因此，这就要求技术人员不能只是会做简单的输入输出工作，必须要有较高的专业技术水平，通过各种检测软件来检查网络系统的漏洞，并且一旦发现病毒入侵就要及时采取相应的措施来补救。
建立完善的开发规则。在对网络代码进行编写之前，应该把系统工程方法作为基础，并在此基础上组织实施网络开发。只有在详细设计被批准通过的基础上，编码工作才可以进行。与此同时，假如在编写代码的过程中出现了错误并需要进行修改，那必须首先对详细设计进行修改，然后对修改后的详细设计进行审批，只有审批通过才能继续进行编写代码的工作。此外，应该采取相应措施对数据库表进行加密，然后再一并存储到数据库中。
改善后台管理系统的网页设计。在网站开发之中，不能在公共网络暴露后台管理系统的接口，而是需要在一个单独的页面上进行设计，这就需要通过内网或者VPN的方式接入这个页面。此外，设计人员在设计的时候要严格把控密码等重要信息的验证。对于网站开发过程中后台管理系统网页设计中的其它的一些规则，比如说，只有在特定的IP地址才能成功登录计算机等，像这类规则它们的灵活度比较高，所以设计人员可以根据具体的需求做出相应的调整。但是需要注意的一点是，只有系统管理员才有权利掌握后台管理系统的入口网址，为了网站数据库系统的安全性起见，这个入口网址其他人是无权知道的。
提高源代码的质量。在编写代码的时候，要尽量避免因为使用SQL语句而造成的注入漏洞。首先，要完善网站系统的管理权限，程序中不能够使用较高的权限来对数据库进行访问。其次，开发系统流程时要确保有良好的程序，比如说在编写数据库查询程序的时候应用replace函数，或者采用两个单引号的方式对输入变量进行标注。最后，将核心的代码隐藏起来，具体的来讲就是为了保护数据库结构以及核心程序代码，在直接访问数据库的时候不利用SQL语句，而是采用XML Web Service或者存储过程。
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