服务器的安全设置很重要，所以相对也会很繁琐，需要进行的操作有很多：
系统漏洞扫描与修复；管理员账号、来宾账号、普通账号、影子账号的优化保护系统不被黑客恶意添加或修改；对IIS下的ASP、ASPX网站相关的EXE和DLL文件进行保护操作防止网站被恶意上传和特殊权限的运行；对系统文件夹下的关键二进制文件进行保护操作，确保存储的DLL文件和以及其他用于支持、配置或操作的文件的安全；对系统文件夹下的文件进行保护操作，防止系统文件被修改，以确保系统的正常运行；对用户配置信息的文件夹进行保护操作，以防止用户当前桌面环境、应用程序设置和个人数据信息的泄露；对数据库进行权限优化以及安全加固；停止了类似Remote Registry（远程修改注册表服务） Remote Desktop Help Session Manager（远程协助服务） 这种不必要的服务，以防被黑客利用，降低安全隐患；关闭135和445这类用于远程过程调用，局域网中轻松访问各种共享文件夹或共享打印机的端口；禁止掉ICP空连接功能，以防止连接者与目标主机建立无需用户名与密码的空连接造成的风险出现；配置backlog，提高网络并发性及网络的处理能力；优化设置SYN-ACK等待时间，检查无效网关用以提高网络性能；检查TCPIP协议栈IGMP堆栈溢出本地拒绝服务、检查ICMP重定向报文，并进行优化操作，防止被用于攻击；禁止路由发现功能，用以防止ICMP路由通告报文带来的增加路由表纪录的攻击；限制处于TIME_WAIT状态的最长时间，使运行的应用程序可以更快速地释放和创建连接；卸载掉wshom.ocx组件和shell32.dll组件，防止默认允许asp运行、exe可执行文件带来的安全隐患；禁止掉系统自动启动服务器共享的功能，用以防止服务器上的资源被共享功能泄露出去。
在手动配置的同时也可以使用安装相应的服务器安全防御软件：云锁、安全狗等。
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